前往原始母星的任务时猎人号不能跟随，于是昆吾将其留在涅槃号上，将控制权限交给了老博士。
老博士就利用这段时间为猎人号又进行了一次最大规模的全面升级。
以往猎人号因为无法完全的停机，所有的升级都只是从局部更替方的式，而这一次猎人号可以完全停机，于是老博士是从基础架构之上动的手脚。
毕竟贺兰博士并不是战舰技术专家，猎人号的整体设计是有缺陷的。
而这一次林凉老博士带着最优秀的战舰设计专家对猎人号进行了基底重设，之后再全面使用JYS技术让猎人号以“生长”的方式重新生长起来。
猎人号的主机当然不会更换，所有的核心组件也依然存在，但却以更加合理和高效的方式重组。
再加上基底重新的设计和所有主结构全面使用JYS技术，一些本来无法加载上去的功能也可以加载了。
新猎人号形态有了一些变化，旧猎人号考虑更多的是探索和隐匿行动。而新猎人号就必需考虑到正面作战和极限生存问题。
所以新猎人号在战斗力和极限生存方面提升的最大。
新猎人号全长522米，最宽处217米，最高处176米，体型比之旧猎人号稍大一点。
内部设施方面，从原一的四个空间扩展区改为了八个，其中四个用于格纳库。另外四个一个用于容纳守卫者生产线，一个用于安装星火战机和自律机器人生产线，一个用于复合生产工厂，最后一个则是特殊训练舱。
在整体格局与功能上面，新猎人号更加的完善与全面。
通过对纳达克上白民技术的全面解析以衣植灵技术的运用，新猎人号拥有一门7级能量度的高能级波能粒子炮。5级能量度副炮四门；4级能量度副炮三十六门，防空近防炮一百八十八门。
因为全舰内外都使用了JYS技术，不但再生能力全面提升，在极端条件下，整个猎人号更是可以分成数个独立的生存舱段，完成单独的太空行踪任务。
动力方面，新猎人号拥有两套全新高效动力炉，其动力水准已经达到了大型星舰标准，另外拥有三套能量线路，两套主机控制线路，两套主机思维核心。
这让猎人号的极限生存能力达到了推演状态的极限。
同时旧猎人号最有特色的隐匿技术也依然保持并再有突破，加入了植灵的隐形科技之后，新猎人号甚至可以做到生态圈高度隐匿，这一项隐匿技术被平宁将军视为昆吾他
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